Mueller gia nhập đội trẻ Bayern Munich năm 2000, trước khi được đôn lên đội hình chính năm 2008, thời điểm mới bước sang tuổi 18. Đến lúc này, tiền đạo 28 tuổi đã có 10 năm chinh chiến trong đội 1 của Hùm xám xứ Bavaria. Hợp đồng hiện tại của Mueller với đội chủ sân Allianz Arena còn thời hạn đến năm 2021 và nhiều người tin rằng anh sẽ gắn bó trọn sự nghiệp của mình với Bayern.
 

 

Là một tiền đạo xuất sắc, Mueller luôn là cái tên thường xuyên được nhắc đến mỗi khi kỳ chuyển nhượng mở cửa. Chân sút từng giành danh hiệu Vua phá lưới World Cup 2010 là mục tiêu được M.U quan tâm trong nhiều năm, nhưng chưa bao giờ thành sự thật. Và trong phát biểu mới đây, Mueller lại khiến các đội bóng thèm muốn mình khấp khởi mừng thầm.

 

"Một thử thách mới có lẽ sẽ thú vị và hấp dẫn tôi. Nếu tình hình khác đi, rất nhiều điều có thể xảy ra. Thông thường thì rất khó để bạn rời khỏi Bayern. Hiện tại tôi cũng chưa có suy nghĩ sẽ làm gì khác", Mueller chia sẻ úp mở với Welt Am Sonntag.

 

Cùng với Bayern, Mueller đã giành 7 chức vô địch Bundesliga, 4 cúp quốc gia Đức cũng như danh hiệu Champions League mùa 2012/13. Anh đã có 38 bàn thắng sau 90 trận khoác áo ĐT Đức và đang là niềm hy vọng của Die Mannschaft ở World Cup 2018.